Ny NCI-direktør forventer, at store data revolutionerer kræftforskning, pleje

Ned Sharpless

Daniel Sone / National Cancer Institute

Ny NCI-direktør forventer, at store data revolutionerer kræftforskning, pleje

Af Jocelyn KaiserDec. 21, 2017, 15:10

Kræftforskere var tidligt i år nervøse over, hvem præsident Donald Trump ville vælge at erstatte Harold Varmus som direktør for National Cancer Institute (NCI). Men i juni var deres frygt for en utraditionel kandidat ubegrundet, da han bankede på Norman N Sharpless. Sharpless, 51, der dengang var direktør for Lineberger Comprehensive Cancer Center på University of North Carolina (UNC) i Chapel Hill, kontrollerede alle de rigtige kasser til samfundet: Han er en læge-videnskabsmand, der behandler patienter, han har startet to biotekvirksomheder, og han driver et grundlæggende forskningslaboratorium fokuseret på p16 a protein vigtigt for celledeling og aldring.

Sharpless, der begyndte at arbejde i oktober, overtager Doug Lowy, den fungerende direktør, siden Varmus forlod i marts 2015. Sharpless har brugt de sidste 2 måneder på at absorbere oplysninger om instituttet på 5, 7 milliarder dollars. Han har talt med alle seks tidligere NCI-direktører, for eksempel, samt NCI-modtagere og intramuralt personale.

I ugen med ScienceInsider afviste Sharpless at lægge specifikke planer. Men han nævnte tre områder, der er vigtige for ham: big data, grundlæggende forskning og oversættelse af opdagelser til enheder og behandlinger. He s har også tænkt på måder at styrke karrierer for unge efterforskere, et flerårigt spørgsmål for NCI s moderbureau, National Institutes of Health (NIH).

Spørgsmål: Hvorfor vil du være NCI-direktør?

A: Min gamle chef Ron DePinho [Sharpless s postdoktorådgiver, nu ved MD Anderson Cancer Center i Houston, Texas], som nominerede mig til jobbet, kaldte faktisk for at overbevise mig om, hvorfor jeg skulle overveje at gøre det. Og jeg stoppede ham slags i mellemtiden og sagde Vent, Ron, du havde mig hos NCI-direktør.

Jeg tror virkelig det er en særlig tid inden for kræftforskning. Vi har denne grundlæggende biologiske forståelse og forestillingen om, at kræft er tusinder af forskellige sygdomme, og det har virkelig givet os mulighed for at fremskynde fremskridt. Vi vil huske dagens kræftforskere, som vi taler om [Louis] Pasteur og [Robert] Koch og antibiotika. Muligheden for at blive involveret på dette tidspunkt var bare for meget til at videregive.

Vent, Ron, du havde mig hos NCI-direktør.

Ned Sharpless, National Cancer Institute

Q: IBMs indsats for at bruge Watson supercomputer til at guide kræftbehandlinger har været kontroversiel. Hvad er dine tanker om big data?

A: Jeg er 100% overbevist om, at området med kunstig intelligens og maskinlæring vil have en enorm indflydelse på kræftforskning og kræftpleje. [På UNC] brugte vi Watson til at organisere litteraturen relateret til nye terapeutiske midler til [vores] molekylære tumorbræt, som prøvede at beslutte, hvilket lægemiddel der skulle gives en patient baseret på [deres tumor] mutation. Den STAT-artikel, som jeg tror, ​​du kaldte, at en paralegal funktion. [Det bemærkede, at Watson samler viden, der blev genereret af andre.] Pointen er, at det er som en million paralegals, der er virkelig, virkelig hurtige, og det er overordentlig nyttigt. Når du begynder at gøre tusind patienter om året, bliver tildelingen af ​​terapiafgørelser meget hård.

Spørgsmål: Er der ikke allerede en masse bestræbelser på at samle data om kræftpatienter som American Association for Cancer Research's Genomics, Evidence, Neoplasia, Information, Exchange ?

A: De kliniske data er den hårde del. Genomiske data er sort / hvid sammenlignet med de kliniske data i elektroniske helbredsregistre. Det er bare for langsomt at have med studerende at læse diagrammer og abstrahere dem, og derfor er disse værktøjer, der bruger naturlig sprogbehandling til at udtrække posterne, meget nyttige. Det vil give os en million patienter, der er klinisk kommenteret og samlet med genomiske datasæt. Det giver os mulighed for at gøre de slags ting, vi virkelig har brug for.

Spørgsmål: Hvor skal NCI hen med immunterapi?

A: For omkring 6 år siden klagede en af ​​de øverste ledere for immunterapibevægelsen til mig over, hvordan NCI's portefølje til immunterapiforskning var lille og ikke havde nok grundlæggende videnskaber eller kliniske forsøg. Jeg tror ikke, nogen kunne komme med den erklæring om NCI-porteføljen i dag. Det er vigtigt, at det inkluderer en virkelig stærk forpligtelse til grundlæggende videnskab. Vi forstår bare ikke cellebiologi godt nok til at gøre fuld terapeutisk brug af immunoterapier.

Jeg er lidt bekymret for, at unge efterforskere bliver demoraliserede. Det er et meget hårdt finansieringsmiljø.

Ned Sharpless, National Cancer Institute

Spørgsmål: Er du bekymret for de drastiske nedskæringer i NIH-budgettet for 2018, som Trump-administrationen har foreslået?

A: Jeg er forpligtet til at støtte præsidentens budget. Jeg vil sige, at kongresforpligtelsen over for [NIH] har været god. Budgettet er steget markant i de sidste 2 år, og [det foreløbige kongres] -budget for 2018 ser også lovende ud. Jeg synes, at de budgetmæssige udfordringer er reelle. For hvis man tænker på kræftbyrden eller hvad det koster samfundet, er selv 5, 7 milliarder dollars ikke rigtig nok.

Men jeg vil hævde, at en endnu sværere udfordring for NCI-direktøren er bare omfanget og omfanget af dette sted. [Det er] vanskeligt, især for en ekstramural videnskabsmand som mig at komme ind og lede den. Derfor er jeg så glad for at have hjælp fra [NCI-viceadministrerende direktør] Doug Lowy, der var fungerende direktør i 2 år og også Harold Varmus 'viceadministrerende direktør.

Spørgsmål: Hvad er dine tanker om NIH's bestræbelser på at hjælpe unge forskere?

A: En idé, vi har sparret rundt, er at give et undergruppe af nye, unge efterforskere en længere periode med R01-lignende [forskningsstøtte] -finansiering. Så i stedet for at stoppe bevillingen til 5 år, ville de indsende en lidt mere markant pakke end en almindelig ikke-konkurrencefornyelse. Og hvis det er godkendt, får de 2 års ekstra finansiering. Denne godkendelsesproces ville være mere eller mindre bare for at sikre, at de stadig gør fremskridt.

Vi er klar over, at der er et intensivt pres på det unge fakultet for at få data sammen, før de kan få deres anden bevilling og få opsigelse. Jeg er lidt bekymret for, at unge efterforskere bliver demoraliserede. Det er et meget hårdt finansieringsmiljø. Jeg vil sende beskeden om, at vi er meget modtagelige for forslag fra unge efterforskere, og at vi er forpligtet til at få deres succes.

Sp .: Planlægger du at have et laboratorium på NIH?

A: De fleste af de mennesker, der arbejdede for mig i [UNC], har nu fået deres egne job. Men jeg har nogle knock-in mus, som jeg producerede i mit laboratorium, som jeg prøver at importere til NCI, så jeg kan starte en lab-indsats her. Det er meget vigtigt for mig. Det er bare dejligt at tænke på videnskab. Det er rart at forstå problemerne fra en fungerende videnskabsmand.